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良太开船去找男孩失踪的哥哥,遇到暴风雨漂流岛一座岛上,在那岛上发现了龙虾怪兽伊比拉,还有在岛上进行一项不为人知计划的神秘组织红竹,正巧碰到一位女原住民,通过她的帮助下四人潜入红竹的基地,竟发现哥斯拉在岛上的洞穴中休眠…….